RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 A0A1B0GWA3 101 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C17orf51A8MQB3 221 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IQCF6A8MYZ5 107 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C11orf94C9JXX5 98 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 K7EMI3 77 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TRBV12-3P01733 135 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IFI6P09912 130 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CKS2P33552 79 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 KIAA0087Q14695 138 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 DIRC1Q969H9 104 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 POLEQ07864 2286 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 THADAQ6YHU6 1953 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 DOCK11Q5JSL3 2073 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1D-33P01593 117 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-33P01594 117 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 BLCAPP62952 87 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CXCL6P80162 114 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RHOHQ15669 191 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 Q1T7F1 81 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C6orf99Q4VX62 202 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 Q6JHZ5 121 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SPTSSAQ969W0 71 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 HIST1H4GQ99525 98 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LTBP4Q8N2S1 1624 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 EML5Q05BV3 1969 aa2.56□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 E7EQL1 145 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NDUFC1O43677 76 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CCL4P13236 92 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 KLKP1Q107X0 134 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ATXN8Q156A1 80 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LINC01554Q52M75 96 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CLLU1OSQ5K130 101 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 Q6ZR03 302 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LYZL2Q7Z4W2 148 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 BPESC1Q9GZL8 116 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.55□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 MGAMO43451 1857 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 COL4A6Q14031 1691 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 E7EUB6 86 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SPINK4O60575 86 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGLV3-27P01718 113 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CISD3P0C7P0 127 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 UBE2AP49459 152 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 MFAP2P55001 183 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ESRGQ1W209 222 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 GUSBP11Q6P575 273 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C2orf82Q6UX34 121 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LYPD6Q86Y78 171 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 DAND5Q8N907 189 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NABP2Q9BQ15 211 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 NHSQ6T4R5 1651 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 A0A096LNJ9 63 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 A0A0J9YXV3 536 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C12orf77C9JDV5 145 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 PSPHP1O15172 72 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGLV2-8P01709 118 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV4-34P06331 123 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 FCER1GP30273 86 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 PATE2Q6UY27 113 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.53□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms