RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TRACP01848 142 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 RP1P56715 2156 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0B4J2C4 111 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 HAMPP81172 84 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG11BQ08648 103 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01548A6NM66 108 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2AP49459 152 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM258P61165 79 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 PRR31Q5SQ13 230 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 BRI3O95415 125 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MORN5Q5VZ52 161 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 PRB1P04280 392 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGLC6P0CF74 106 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 GTSF1Q8WW33 167 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 A0A096LPF7 62 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GXF2 115 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGLL5B9A064 214 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 H3BMG7 143 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 RS1O15537 224 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N6K4 173 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MSMPQ1L6U9 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf38Q86SI9 138 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF843Q8N446 348 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-30P01768 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-33P01772 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 PRAC2D3DTV9 90 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MRAPQ8TCY5 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0J9YXV3 536 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MP68P56378 58 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 NOTCH4Q99466 2003 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 Q9HAA7 133 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ATOX1O00244 68 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 COX7BP24311 80 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MIAQ16674 131 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB135Q30KP9 77 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 hADV29S1A0JD25 119 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 U3KQK5 164 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TIMM17BO60830 172 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 PI4KAP42356 2102 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ARID1AO14497 2285 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 F8WDY8 70 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ODF1Q14990 250 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 MLST8Q9BVC4 326 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 NREPQ16612 68 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 PSMB8P28062 276 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf84I3L1E1 186 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZSV7 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TEN1Q86WV5 123 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF702PQ9H963 129 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 ETDBQ3ZM63 59 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV1-40P01703 118 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-208ENST00000550358 E7EUB6 86 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 REG3AQ06141 175 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 PCP2Q8IVA1 136 aa6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms