RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546889.1

TARBP2-205, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 2

Gene TARBP2, Length 1,063 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-205	ENST00000546889	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	LINC00694	P0DN24	101 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	TMEM250	H0YL14	139 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	CRYGD	P07320	174 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	LINC00315	P59091	139 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889		P01737	135 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	TOR2A	Q5JU69	321 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	TNP2	Q05952	138 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GAGE12J	A6NER3	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889		K7EP13	123 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	IGLC6	P0CF74	106 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GZMB	P10144	247 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	EVI2A	P22794	236 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GAGE1	Q13065	139 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GAGE4	Q13068	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GAGE5	Q13069	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GAGE13	Q4V321	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARBP2-205	ENST00000546889	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	LELP1	Q5T871	98 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	FAM210A	Q96ND0	272 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889		Q9UF83	564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889		K7EN84	100 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	ZNF56	Q15929	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	HERC2	O95714	4834 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	OCC1	Q8TAD7	63 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	CEBPG	P53567	150 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	RAB4B	P61018	213 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	SST	P61278	116 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	TEX261	Q6UWH6	196 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	NUDT11	Q96G61	164 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	CACNG7	P62955	275 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	NFE4	Q86UQ8	179 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889		A0A087WWC5	75 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889		F2Z2F3	143 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	SMIM17	P0DL12	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	CTRL	P40313	264 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TARBP2-205	ENST00000546889	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	UBE2D3	P61077	147 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	UBE2D2	P62837	147 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889		F5H697	171 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	CNFN	Q9BYD5	112 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	MGP	P08493	103 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	NTF3	P20783	257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	LAGE3	Q14657	143 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-205	ENST00000546889	CT83	Q5H943	113 aa		11.97	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms