RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPFFO15130 113 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSN2P05814 226 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP3S1Q92572 193 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-2.02□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKR1D1P51857 326 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDDM3BP56851 147 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTC4SQ16873 150 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX29Q8N6K0 151 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB105AQ8NG35 78 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASZ1Q86V15 1759 aa-2.03□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLPSL1A2RUU4 121 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BQV1 296 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H7C1C5 153 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF609O15014 1411 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CETN3O15182 167 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CKS2P33552 79 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYBA4P53673 196 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCN6P62502 163 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIGYQ3MUY2 71 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIN52Q52LA3 116 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP126Q5VTH2 177 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf33Q6P1S2 294 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A26Q70HW3 274 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STX19Q8N4C7 294 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUP35Q8NFH5 326 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf16Q9BUW7 83 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-2.04□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPPAQ13219 1627 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 J3KT08 172 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIPO00170 330 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARF6P62330 175 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAP1Q96NZ9 151 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS25Q9BRG1 176 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPVFQ9HCQ7 196 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-2.05□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBASA2RRP1 2371 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYSTQ99698 3801 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 G3V2T6 193 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABARAPH6UMI1 98 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HBDP02042 147 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOA2P02652 100 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CST2P09228 141 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFA11Q86Y39 141 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTF3L4Q96K17 158 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LXNQ9BS40 222 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SS18L2Q9UHA2 77 aa-2.06□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNHD1Q96M86 4753 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP5D1E7EU14 171 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYGSP22914 178 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB123Q8N688 67 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSR3Q9UNL2 185 aa-2.07□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKAP13Q12802 2813 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BMG7 143 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDC2P34741 201 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPCS2Q15005 226 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARMC1Q9NVT9 282 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFT172Q9UG01 1749 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TECPR2O15040 1411 aa-2.08□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R2P41236 205 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRK1Q8WUW1 75 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SACSQ9NZJ4 4579 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMXL1Q9Y485 3027 aa-2.09□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WNK3Q9BYP7 1800 aa-2.1□□□□□ -2.74
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX15Q9BXT5 2789 aa-2.1□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms