RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513457.5

LDB2-215, Transcript of LIM domain binding 2, human

TSL 5

Gene LDB2, Length 530 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LDB2-215	ENST00000513457	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	H2BFS	P57053	126 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RAB2A	P61019	212 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PKIA	P61925	76 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	GAGE1	Q13065	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	GAGE4	Q13068	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	GAGE5	Q13069	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	NIT1	Q86X76	327 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	LECT2	O14960	151 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UPK1B	O75841	260 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	CXorf1	O96002	111 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	MB	P02144	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	GCHFR	P30047	84 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457		Q0VG73	95 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457		Q86TA4	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	LINC00479	Q96M42	142 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457		A0A1W2PRE2	83 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457		H3BVH4	76 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DEFA1	P59665	94 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DEFA3	P59666	94 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SERF2	P84101	59 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SGK494	Q96LW2	274 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	EPDR1	Q9UM22	224 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457		B4DEV8	164 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	RAB24	Q969Q5	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.73	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	PEX7	O00628	323 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	IFNA7	P01567	189 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UBE2D3	P61077	147 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UBE2G1	P62253	170 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	UBE2D2	P62837	147 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	MIA	Q16674	131 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LDB2-215	ENST00000513457	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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