RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZSN1 163 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SFRP2Q96HF1 295 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A087WWL8 130 aa13.16□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 GZMBP10144 247 aa13.16□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.15□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.15□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 C16orf90A8MZG2 172 aa13.15□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EN84 100 aa13.15□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.15□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 OCC1Q8TAD7 63 aa13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 TPPP3Q9BW30 176 aa13.14□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 XKRY2A2RUG3 117 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRYGDP07320 174 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLC6P0CF74 106 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00315P59091 139 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKD1P98161 4303 aa13.13□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.12□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUDT11Q96G61 164 aa13.12□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.12□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00694P0DN24 101 aa13.11□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 SSTP61278 116 aa13.11□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.11□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12JA6NER3 117 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIRAPP58753 221 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE1Q13065 139 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE4Q13068 117 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE5Q13069 117 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE13Q4V321 117 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 AP1S3Q96PC3 154 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 HERC2O95714 4834 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.1□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.09□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q9UF83 564 aa13.09□□□□□ -0.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF727A8MUV8 499 aa13.08□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 EVI2AP22794 236 aa13.08□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 CTRLP40313 264 aa13.08□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF56Q15929 161 aa13.08□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.08□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 CACNG7P62955 275 aa13.07□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC01551Q86U37 167 aa13.07□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.07□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9JQL5 133 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 F2Z2F3 143 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMIM17P0DL12 118 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB4BP61018 213 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 NFE4Q86UQ8 179 aa13.06□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.05□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERVFC1-1P60608 527 aa13.05□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.05□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.05□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 EREGO14944 169 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 PEA15Q15121 130 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 LELP1Q5T871 98 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.04□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 F5H697 171 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EP13 123 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 GTSF1Q8WW33 167 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNFNQ9BYD5 112 aa13.03□□□□□ -0.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 MGPP08493 103 aa13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRGC1P0CF51 173 aa13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 CT83Q5H943 113 aa13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.02□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.01□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.01□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.01□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 A8MWL6 223 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 NTF3P20783 257 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2D3P61077 147 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB14P61106 215 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2D2P62837 147 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM241Q24JQ0 296 aa13□□□□□ -0.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR73Q6P4I2 378 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms