RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500025.2

CSTF3-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSTF3-AS1, Length 2,031 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NTF3P20783 257 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZNF138P52744 262 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TDRG1Q3Y452 100 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 Q8N976 141 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DUX3Q96PT4 197 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.54□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IGLC6P0CF74 106 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PMCHL1Q16048 86 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PRR9Q5T870 116 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GATD1Q8NB37 220 aa6.53□□□□□ -1.36
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 F6UB75 175 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SCGB1A1P11684 91 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KRTDAPP60985 99 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PKIAP61925 76 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 Q6AWC8 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 A0A1B0GV90 55 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CTRLP40313 264 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.52□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TSTD3H0UI37 97 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE7O76087 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C3orf79P0CE67 100 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE12FP0CL80 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE12GP0CL81 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE12IP0CL82 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SLURP1P55000 103 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE1Q13065 139 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAGE4Q13068 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 AMN1Q8IY45 258 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 BORCS7Q96B45 105 aa6.51□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 OR5AL1P0C617 328 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 A0A087WW49 117 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 M0R2Z0 102 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CRLF1O75462 422 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DDTP30046 118 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TWIST1Q15672 202 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 D6R8Y8 96 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SYNJ2BPP57105 145 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DCANP1Q8TF63 244 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SIGMAR1Q99720 223 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C2orf70A6NJV1 201 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 OVOL1O14753 267 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GAS8-AS1O95177 125 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 Q8N2B8 174 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C14orf144Q96I85 54 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LINC00477Q96M19 166 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 U3KQK5 164 aa6.49□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CUBNO60494 3623 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 DEFB136Q30KP8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TEX29Q8N6K0 151 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RNF185Q96GF1 192 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CNFNQ9BYD5 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PRO0628Q9UI54 55 aa6.48□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NCR2O95944 276 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MED14OSP0DP75 135 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PRELID3AQ96N28 172 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NPYP01303 97 aa6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms