RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495663.1

RAB11FIP3-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RAB11FIP3, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SFRP2Q96HF1 295 aa7.15□□□□□ -1.26
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C18orf15Q96N68 181 aa7.15□□□□□ -1.26
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.15□□□□□ -1.26
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SEC11CQ9BY50 192 aa7.15□□□□□ -1.26
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.15□□□□□ -1.26
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RYR3Q15413 4870 aa7.15□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A0A1W2PPQ1 181 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NUPR2A6NF83 97 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A8MWL6 223 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SNAI2O43623 268 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR5AL1P0C617 328 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.14□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 F2Z2F3 143 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C3orf84H3BNL1 204 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 M0R381 172 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLC6P0CF74 106 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HTN3P15516 51 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ADCYAP1P18509 176 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZFP82Q8N141 532 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TPPP3Q9BW30 176 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NACAE9PAV3 2078 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A8MWV9 139 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TSKUQ8WUA8 353 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 V9GYV3 84 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM231BA6NCW3 169 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 F5H768 121 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PPP1R2P9O14990 202 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RS1O15537 224 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CIDEAO60543 219 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NXPH4O95158 308 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3-53P01767 116 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CTRLP40313 264 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CACNG7P62955 275 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NDUFA5Q16718 116 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GTSF1Q8WW33 167 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MT-ND4LP03901 98 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SSTP61278 116 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RNF212Q495C1 297 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CASC10Q5T4H9 136 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 WDR73Q6P4I2 378 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BORCS7Q96B45 105 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF479Q96JC4 524 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM210BQ96KR6 192 aa7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HIGD1CA8MV81 97 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLL5B9A064 214 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RHODO00212 210 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SLAQ13239 276 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 AP1S3Q96PC3 154 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CNFNQ9BYD5 112 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 JPT2Q9H910 190 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.09□□□□□ -1.27
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRGC1P0CF51 173 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NTF3P20783 257 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GCSHP23434 173 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TCTAP57738 103 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TWIST1Q15672 202 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRO0255Q9UI72 69 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.08□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A0A087WWL8 130 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A0A1B0GUT8 65 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 APOC3P02656 99 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SMIM17P0DL12 118 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CRYBA4P53673 196 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NUP35Q8NFH5 326 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.07□□□□□ -1.28
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126 ms