RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495606.5

IMP4-217, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene IMP4, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-217ENST00000495606 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.05□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.05□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.05□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 H3BNG1 76 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 SLAQ13239 276 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 GTSF1Q8WW33 167 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 NAT8Q9UHE5 227 aa10.04□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 K7EQD1 137 aa10.03□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 NXPH4O95158 308 aa10.03□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.03□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 ISOC2Q96AB3 205 aa10.03□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.03□□□□□ -0.8
IMP4-217ENST00000495606 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.02□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 XKRY2A2RUG3 117 aa10.02□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.02□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 GAGE12JA6NER3 117 aa10.01□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 M0R2N4 97 aa10.01□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 GAGE5Q13069 117 aa10.01□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 GAGE13Q4V321 117 aa10.01□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 OSTCQ9NRP0 149 aa10.01□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 NTF3P20783 257 aa10□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 CCL18P55774 89 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 RNF212Q495C1 297 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 LYPD5Q6UWN5 251 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 COMMD7Q86VX2 200 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 OR10G8Q8NGN5 311 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 PRADC1Q9BSG0 188 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 V9GYV3 84 aa10□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 A0A1W2PPQ1 181 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 A8MWL6 223 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 F2Z2F3 143 aa9.99□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 CTRLP40313 264 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 LINC00315P59091 139 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 CACNG7P62955 275 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 RHOHQ15669 191 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 TWIST1Q15672 202 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.99□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 F5H697 171 aa9.98□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 ZNF56Q15929 161 aa9.98□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 AP1S3Q96PC3 154 aa9.97□□□□□ -0.81
IMP4-217ENST00000495606 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.97□□□□□ -0.81
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IMP4-217ENST00000495606 ADCYAP1P18509 176 aa9.96□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 CT83Q5H943 113 aa9.96□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 TMEM218A2RU14 115 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 LINC00862A6NCI5 91 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 HIGD1CA8MV81 97 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 RAB4BP61018 213 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 WDR73Q6P4I2 378 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 Q9H8V8 135 aa9.95□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 UQCC3Q6UW78 93 aa9.94□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 NUP35Q8NFH5 326 aa9.94□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.94□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 CNFNQ9BYD5 112 aa9.94□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 F8W036 122 aa9.93□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 TRGC1P0CF51 173 aa9.93□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 LINC00694P0DN24 101 aa9.93□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.93□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.93□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.92□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.92□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.92□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.92□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 A0A1B0GUT8 65 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 M0QY20 66 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 Q6ZR54 194 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 BORCS7Q96B45 105 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 UPK3BQ9BT76 320 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.91□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.9□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 FAM231BA6NCW3 169 aa9.9□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 UBE2D3P61077 147 aa9.9□□□□□ -0.82
IMP4-217ENST00000495606 UBE2D2P62837 147 aa9.9□□□□□ -0.82
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