RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.41□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 LPAP08519 4548 aa-0.41□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 FLNCQ14315 2725 aa-0.41□□□□□ -2.47
ITGA4-211ENST00000490435 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.41□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NMBP08949 121 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 OR8B8Q15620 311 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 IFI27L1Q96BM0 104 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 BANF2Q9H503 90 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 GINS2Q9Y248 185 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 LAMB1P07942 1786 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CACNA1AO00555 2505 aa-0.42□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 HSPG2P98160 4391 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TSTD3H0UI37 97 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TNFSF15O95150 251 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SCTP09683 121 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CCL3L1P16619 93 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 MT4P47944 62 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NCOR1O75376 2440 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM24O75264 130 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NBEAP1P0C6P0 100 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NPC2P61916 151 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 Q96NJ1 140 aa-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 PARP14Q460N5 1801 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 DEGS1O15121 323 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.45□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 RBP4P02753 201 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 COX4I1P13073 169 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 CLLU1Q5K131 121 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 ERG28Q9UKR5 140 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 MYCBP2O75592 4640 aa-0.46□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.47□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.47□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.47□□□□□ -2.48
ITGA4-211ENST00000490435 M0R2P5 195 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 YPEL1O60688 119 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 APODP05090 189 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 CMPK1P30085 196 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 C4orf33Q8N1A6 199 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.48□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC179H3BU77 68 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 J3QLW9 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 C20orf197Q8N268 126 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.49□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 MUC17Q685J3 4493 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 ERCC6Q03468 1493 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SYNJ1O43426 1573 aa-0.5□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 H0YJX3 145 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF292O60281 2723 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SPCS2Q15005 226 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZRX8 168 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.51□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 MORN2Q502X0 79 aa-0.52□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.52□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 V9GYV3 84 aa-0.52□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 SPTBN2O15020 2390 aa-0.52□□□□□ -2.49
ITGA4-211ENST00000490435 MYH6P13533 1939 aa-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms