RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 M0R381 172 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 OR5AL1P0C617 328 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 GNG4P50150 75 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-209ENST00000485765 RBFOX3A6NFN3 312 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-209ENST00000485765 K7EP13 123 aa12.95□□□□□ -0.34
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NISCH-209ENST00000485765 PEA15Q15121 130 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-209ENST00000485765 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NISCH-209ENST00000485765 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-209ENST00000485765 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.94□□□□□ -0.34
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NISCH-209ENST00000485765 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.91□□□□□ -0.34
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NISCH-209ENST00000485765 EVI2AP22794 236 aa12.9□□□□□ -0.34
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NISCH-209ENST00000485765 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 P01737 135 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 GZMBP10144 247 aa12.88□□□□□ -0.35
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NISCH-209ENST00000485765 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.88□□□□□ -0.35
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NISCH-209ENST00000485765 XKRY2A2RUG3 117 aa12.86□□□□□ -0.35
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NISCH-209ENST00000485765 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 F2Z2F3 143 aa12.85□□□□□ -0.35
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NISCH-209ENST00000485765 WDR73Q6P4I2 378 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-209ENST00000485765 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 UBE2D3P61077 147 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 SSTP61278 116 aa12.83□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 UBE2D2P62837 147 aa12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-209ENST00000485765 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
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NISCH-209ENST00000485765 AP1S3Q96PC3 154 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 TPPP3Q9BW30 176 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1109Q2LD37 5005 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 LRP1BQ9NZR2 4599 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 FAM74A3Q4VXF1 159 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.81□□□□□ -0.36
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NISCH-209ENST00000485765 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 SMIM17P0DL12 118 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 FAM231DQ6ZW35 169 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 F5H697 171 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-30P01768 117 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-33P01772 117 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 NTF3P20783 257 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 CTRLP40313 264 aa12.79□□□□□ -0.36
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