RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.13□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 B4DEV8 164 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 RHODO00212 210 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 CXorf1O96002 111 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC11BP0C7V7 166 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V0CP27449 155 aa6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WWL8 130 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WX48 190 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PRE2 83 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 MBP02144 154 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 Q86TA4 180 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.11□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.1□□□□□ -1.43
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SMARCE1-210ENST00000481231 CRIP1P50238 77 aa6.1□□□□□ -1.43
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SMARCE1-210ENST00000481231 ELOBQ15370 118 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 DNLZQ5SXM8 178 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 AQP10Q96PS8 301 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R381 172 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D1AO60880 128 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFA1P59665 94 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFA3P59666 94 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2G2P60604 165 aa6.09□□□□□ -1.43
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SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2D2P62837 147 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF726P1Q15940 193 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 SFRP2Q96HF1 295 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-210ENST00000481231 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 C14orf177Q52M58 125 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ENHOQ6UWT2 76 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ALG5Q9Y673 324 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC2Q02817 5179 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM74A7A6NL05 159 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 USP17L23D6RBM5 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM262E9PQX1 116 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
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SMARCE1-210ENST00000481231 Q0VG73 95 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP82Q8N141 532 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.07□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 LPAP08519 4548 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 CRPP02741 224 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01559Q495D7 138 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MPV17L2Q567V2 206 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 Q5BKY6 102 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZRU5 148 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DQA1P01909 254 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS1P07477 247 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 FMC1Q96HJ9 113 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 PANO1I0J062 215 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 PTTG1O95997 202 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 LTAP01374 205 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB4BP61018 213 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2G1P62253 170 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF56Q15929 161 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR27Q6MZM9 219 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 A6NHS1 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MIAQ16674 131 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.03□□□□□ -1.44
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