RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF492Q9P255 531 aa2.58□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ANK2Q01484 3957 aa2.58□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 DNHD1Q96M86 4753 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 I3L2K1 104 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 PEX7O00628 323 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LTAP01374 205 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGKV1-17P01599 117 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 HLA-DQA1P01909 254 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGLC1P0CG04 106 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RD3LP0DJH9 198 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 CRISP2P16562 243 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RANP62826 216 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RHOGP84095 191 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF90Q03938 601 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RPEL1Q2QD12 228 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TIGITQ495A1 244 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LCE1CQ5T751 118 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TOMM20LQ6UXN7 152 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 Q6ZVH6 145 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR5T1Q8NG75 326 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 CMTM2Q8TAZ6 248 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TSKUQ8WUA8 353 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LINC00167Q96N53 147 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ENY2Q9NPA8 101 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM14CQ9P0S9 112 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 NAGKQ9UJ70 344 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 EPDR1Q9UM22 224 aa2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 A0A1B0GV90 55 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C2orf70A6NJV1 201 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 PANO1I0J062 215 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 K7EIM0 57 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LGALS9O00182 355 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 CORTO00230 105 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR7C2O60412 319 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGHV3-48P01763 117 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 PYYP10082 97 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 BMI1P35226 326 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 SLAQ13239 276 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 DEFB136Q30KP8 78 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TDRG1Q3Y452 100 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LCN12Q6JVE5 192 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 NUP35Q8NFH5 326 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 KCNS1Q96KK3 526 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 GPR82Q96P67 336 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 PRO1933Q9H354 126 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.56□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 H3BRN7 92 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 COX7A2P2O60397 106 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGHV3-11P01762 117 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 TCRAP04437 139 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C3orf79P0CE67 100 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGLC2P0DOY2 106 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 IGLC3P0DOY3 106 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 SRIP30626 198 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 C19orf35Q6ZS72 473 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 BAGE2Q86Y30 109 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 GPHB5Q86YW7 130 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 FMC1Q96HJ9 113 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.55□□□□□ -2
MFSD1-211ENST00000476860 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms