RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.2□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 COL12A1Q99715 3063 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX29Q8N6K0 151 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 PRO1854Q9UHT4 67 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa10.15□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 CCL21O00585 134 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP1-206ENST00000469947 NXPH4O95158 308 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV3-20P01619 116 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC179H3BU77 68 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0J9YXV3 536 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 NPC2P61916 151 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF56Q15929 161 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.09□□□□□ -0.79
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