RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 LRBAP50851 2863 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 A0A0J9YX75 114 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 GAGE12BA1L429 117 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 A6NJY4 79 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 K7EP34 96 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 FSHBP01225 129 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 FXYD7P58549 80 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 RHOHQ15669 191 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 Q6YL49 198 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PCP2Q8IVA1 136 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CEND1Q8N111 149 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 C9orf85Q96MD7 179 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPM0 123 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 E9PLD3 99 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 GNRH2O43555 120 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 GAS8-AS1O95177 125 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 MGPP08493 103 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CD7P09564 240 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CRYBA4P53673 196 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 RIPPLY3P57055 190 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 SCGB2A2Q13296 93 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TMEM86BQ8N661 226 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 JMJD8Q96S16 334 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CSTL1Q9H114 145 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PEMTQ9UBM1 199 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CREBBPQ92793 2442 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-59P01825 116 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 LINC00315P59091 139 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PMVKQ15126 192 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 Q8N2B8 174 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CST9LQ9H4G1 147 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 ITPR2Q14571 2701 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 AKAP9Q99996 3911 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 A8MTW9 85 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 H3BUT2 72 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 GCSHP23434 173 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 BAALCQ8WXS3 180 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GWB2 263 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 C11orf86A6NJI1 115 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 F5H697 171 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 F6UB75 175 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 J3KRW8 73 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 LY6G6DO95868 133 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZS46 218 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZVH6 145 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H4GQ99525 98 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.391e-32■■■■■ 30
ACTB-208ENST00000464611 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-208ENST00000464611 NOTCH2Q04721 2471 aa6.34□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 ITPR3Q14573 2671 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TACC2O95359 2948 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 IGIPA6NJ69 53 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 A8MWV9 139 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 F8W1H4 67 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 I3L3M4 83 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 J3QR89 54 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RBX1P62877 108 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ACTB-208ENST00000464611 SPXQ9BT56 116 aa6.33□□□□□ -1.4
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