RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 F8P00451 2351 aa6.53□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 WIPF1O43516 503 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 SFTA2Q6UW10 78 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 ZMAT4Q9H898 229 aa6.52□□□□□ -1.36
LMO3-210ENST00000453727 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC01549A6NIU2 74 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LYZP61626 148 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 GATD1Q8NB37 220 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FXYD5Q96DB9 178 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 NF1P21359 2839 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 INAFM1C9JVW0 142 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CRLF1O75462 422 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ATP5LO75964 103 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CTSGP08311 255 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 MYCNOSP40205 109 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TMEM86BQ8N661 226 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 RASL10AQ92737 203 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CCDC140Q96MF4 163 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRGV3P03979 118 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CKS2P33552 79 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CFHR3Q02985 330 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC01559Q495D7 138 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ESM1Q9NQ30 184 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 MDFICQ9P1T7 246 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TCRAP04437 139 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC00694P0DN24 101 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 C3orf56Q8N813 242 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 RNF125Q96EQ8 232 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 KLK15Q9H2R5 256 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FAM223BA6NKX1 122 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 NPYP01303 97 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 IGLV1-40P01703 118 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LEPP41159 167 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 PRNTQ86SH4 94 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 AMN1Q8IY45 258 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZNF702PQ9H963 129 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZNF580Q9UK33 172 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 U3KQK5 164 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 H3BUA1 57 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZQT7 251 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC01619G3V211 115 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TCL1BO95988 128 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 UBE2D3P61077 147 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 UBE2D2P62837 147 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 HILS1P60008 231 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 Q86TA4 180 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 J3KT08 172 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-11P01762 117 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 USMG5Q96IX5 58 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 Q9H3A6 140 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 C9JAW5 83 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 H3BRN7 92 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A20O43772 301 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRBV12-3P01733 135 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 GP9P14770 177 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 PSMB8P28062 276 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 LINC01587Q99440 93 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZSV7 163 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 Q8N2B8 174 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms