RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 CACNG7P62955 275 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 CNFNQ9BYD5 112 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GUT8 65 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 M0R2P5 195 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 WDR73Q6P4I2 378 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 ZFP82Q8N141 532 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SYT8Q8NBV8 401 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 BTF3L4Q96K17 158 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 M0R381 172 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SPINK4O60575 86 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 NXPH4O95158 308 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SSTP61278 116 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 RIGQ13278 110 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 ELOBQ15370 118 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 PTH2Q96A98 100 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 NTF3P20783 257 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TWIST1Q15672 202 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 ZNF876PQ49A33 203 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 YPEL4Q96NS1 127 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GW15 77 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 HBBP68871 147 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 RASL10AQ92737 203 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DKK2Q9UBU2 259 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 PKD1P98161 4303 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GXF2 115 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 LYRM9A8MSI8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 S100A8P05109 93 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TRGC1P0CF51 173 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 CAMPP49913 170 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZTI0 123 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 AP1S3Q96PC3 154 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 NACAE9PAV3 2078 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 RYR1P21817 5038 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 RASL11AQ6T310 242 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 FAM210BQ96KR6 192 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GAGE12BA1L429 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 A8MWV9 139 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GAGE7O76087 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GAGE12FP0CL80 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GAGE12GP0CL81 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GAGE12IP0CL82 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DAD1P61803 113 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 COX19Q49B96 90 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 COLCA2A8K830 154 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 SMIM17P0DL12 118 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DEFB130BP0DP73 79 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 DEFB130AP0DP74 79 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 EVI2AP22794 236 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 RAB4BP61018 213 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZR54 194 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 GATD1Q8NB37 220 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 JPT2Q9H910 190 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WWL8 130 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 RS1O15537 224 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 C18orf15Q96N68 181 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 RHODO00212 210 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DQA1P01909 254 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 MT-ND6P03923 174 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 CRYGDP07320 174 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 MGPP08493 103 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 RAB5AP20339 215 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-208ENST00000438888 AMN1Q8IY45 258 aa8.69□□□□□ -1.02
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