RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR5AL1P0C617 328 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q6ZR54 194 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC01551Q86U37 167 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYT8Q8NBV8 401 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GTSF1Q8WW33 167 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM12Q96EX1 92 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SFRP2Q96HF1 295 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAGE12JA6NER3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF727A8MUV8 499 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A8MWV9 139 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRIP30626 198 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTRLP40313 264 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAGE1Q13065 139 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAGE4Q13068 117 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAGE5Q13069 117 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RHOHQ15669 191 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF212Q495C1 297 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAGE13Q4V321 117 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q8N3U1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RTL8CO15255 209 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCL18P55774 89 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00315P59091 139 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF56Q15929 161 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RHODO00212 210 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MGPP08493 103 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADIRFQ15847 76 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ISOC2Q96AB3 205 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UPK3BQ9BT76 320 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADCYAP1P18509 176 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLAQ13239 276 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLLU1Q5K131 121 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AP1S3Q96PC3 154 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 V9GYV3 84 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RYR1P21817 5038 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EVI2AP22794 236 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PEA15Q15121 130 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q9H8V8 135 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BIN3Q9NQY0 253 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NAT8Q9UHE5 227 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CNFNQ9BYD5 112 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSTCQ9NRP0 149 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HSPG2P98160 4391 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HERC2O95714 4834 aa6.4□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XKRY2A2RUG3 117 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HIGD1CA8MV81 97 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIVA1O15304 175 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAS8-AS1O95177 125 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NTF3P20783 257 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2D3P61077 147 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB14P61106 215 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2D2P62837 147 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CACNG7P62955 275 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CT83Q5H943 113 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GVY2 172 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1W2PPQ1 181 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 F5H697 171 aa6.38□□□□□ -1.39
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CIDEAO60543 219 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms