RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.02□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf52Q96A22 123 aa11.02□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MLST8Q9BVC4 326 aa11.02□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.02□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087WWC5 75 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GNG4P50150 75 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZSN1 163 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DERL1Q9BUN8 251 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MED9Q9NWA0 146 aa11.01□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-30P01768 117 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-33P01772 117 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF56Q15929 161 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UFSP1Q6NVU6 142 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VAX2Q9UIW0 290 aa11□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMIM17P0DL12 118 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL2P10415 239 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMIM12Q96EX1 92 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BIN3Q9NQY0 253 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.99□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XKRY2A2RUG3 117 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR5AL1P0C617 328 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSTP61278 116 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPPP3Q9BW30 176 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q9HAA7 133 aa10.98□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.97□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.97□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.97□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB19A4D1S5 217 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 F5H697 171 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNAI2O43623 268 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 P01737 135 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00694P0DN24 101 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP10-2P60368 255 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB4BP61018 213 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BLOC1S1P78537 153 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AP1S3Q96PC3 154 aa10.96□□□□□ -0.65
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087WTM6 91 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK2AP2O75956 126 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LAGE3Q14657 143 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOR2AQ5JU69 321 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PKD1P98161 4303 aa10.95□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PKHD1P08F94 4074 aa10.94□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.94□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q9UF83 564 aa10.94□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TM2D2Q9BX73 214 aa10.93□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087WX48 190 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLV2-8P01709 118 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GZMBP10144 247 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CACNG7P62955 275 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HERC2O95714 4834 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.92□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.91□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MGPP08493 103 aa10.91□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBE2D3P61077 147 aa10.91□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBE2D2P62837 147 aa10.91□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 F2Z2F3 143 aa10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ELOBQ15370 118 aa10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RMI2Q96E14 147 aa10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H7C1H1 209 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRGC1P0CF51 173 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLC6P0CF74 106 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEBPGP53567 150 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.89□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM262E9PQX1 116 aa10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM250H0YL14 139 aa10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NIT1Q86X76 327 aa10.88□□□□□ -0.67
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q8N3U1 123 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms