RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ATG4B-210ENST00000428861 CXCL1P09341 107 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 MED14OSP0DP75 135 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GNG4P50150 75 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE1Q13065 139 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE4Q13068 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE5Q13069 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE13Q4V321 117 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TTC32Q5I0X7 151 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 ZFP82Q8N141 532 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SYT8Q8NBV8 401 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 TIRAPP58753 221 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 SSTP61278 116 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 BLOC1S1P78537 153 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-210ENST00000428861 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.27□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 Q8N3U1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.27□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 RHODO00212 210 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.26□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 OCC1Q8TAD7 63 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM12Q96EX1 92 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 NUDT11Q96G61 164 aa7.26□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.26□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 LELP1Q5T871 98 aa7.25□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 RYR1P21817 5038 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.24□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-2P60368 255 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 TPPP3Q9BW30 176 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 HSPG2P98160 4391 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM250H0YL14 139 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-30P01768 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-33P01772 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 EVI2AP22794 236 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4B-210ENST00000428861 UBE2D2P62837 147 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF56Q15929 161 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 TEX261Q6UWH6 196 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 GTSF1Q8WW33 167 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.21□□□□□ -1.26
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ATG4B-210ENST00000428861 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.21□□□□□ -1.26
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ATG4B-210ENST00000428861 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 K7EP13 123 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 CTRLP40313 264 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 CACNG7P62955 275 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 AP1S3Q96PC3 154 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.2□□□□□ -1.26
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ATG4B-210ENST00000428861 M0QY20 66 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 NTF3P20783 257 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01551Q86U37 167 aa7.19□□□□□ -1.26
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