RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GW15 77 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 SNURFLB1AK76 121 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ATP5G1P05496 136 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 IGLC6P0CF74 106 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 MED14OSP0DP75 135 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAT1Q14517 4588 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 RTL8CO15255 209 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ORM1P02763 201 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 OR5AL1P0C617 328 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 P0DMU3 169 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAM231AP0DMU4 169 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAM231CP0DMU5 169 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 NUP35Q8NFH5 326 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 GTSF1Q8WW33 167 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 MDFICQ9P1T7 246 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 HIGD1CA8MV81 97 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 SNAI2O43623 268 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 SPINK4O60575 86 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 GATD1Q8NB37 220 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 PTH2Q96A98 100 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FAM210BQ96KR6 192 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GXF2 115 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 RAB5AP20339 215 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 CTRLP40313 264 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF415Q09FC8 603 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 A0A096LPF7 62 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GUT8 65 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GVY2 172 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 MT-ND6P03923 174 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 S100A8P05109 93 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 RIGQ13278 110 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZR54 194 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 GNRH2O43555 120 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 CACNG7P62955 275 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 PHOX2AO14813 284 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 ASIPP42127 132 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 FRZBQ92765 325 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 BORCS7Q96B45 105 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF479Q96JC4 524 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf85Q96MD7 179 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 SPXQ9BT56 116 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 NXPH4O95158 308 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 HLA-DQA1P01909 254 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 GZMBP10144 247 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 NTF3P20783 257 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 HBBP68871 147 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 FHL2Q14192 279 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 ESRGQ1W209 222 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 C18orf15Q96N68 181 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TRGC2P03986 189 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 CRYBA4P53673 196 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TNP2Q05952 138 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 ZFP82Q8N141 532 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 RASL10AQ92737 203 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms