RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3-11P01762 117 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 H7C2G1 150 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 GATA3P23771 443 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.95□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 A0A1W2PPR1 153 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 PPP1R17O96001 155 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 AMELXQ99217 191 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 RNF183Q96D59 192 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.94□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 J3QQQ9 107 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF688P0C7X2 276 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 A0A087WW49 117 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 A4D1N5 150 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 NPFFO15130 113 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 MED14OSP0DP75 135 aa9.93□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 C9JAW5 83 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 VCYO14598 125 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF876PQ49A33 203 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 IGF2RP11717 2491 aa9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 EDN2P20800 178 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM141Q96I45 108 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 SLC25A20O43772 301 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 NXPH4O95158 308 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TIMM17AQ99595 171 aa9.91□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FAM223BA6NKX1 122 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 NDUFA4O00483 81 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ELANEP08246 267 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF580Q9UK33 172 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 ERG28Q9UKR5 140 aa9.9□□□□□ -0.82
ZBED8-201ENST00000408953 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 SORL1Q92673 2214 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV3-33P01772 117 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.89□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 LMO4P61968 165 aa9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 K7ENP7 123 aa9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 LY6EQ16553 131 aa9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 KLLNB2CW77 178 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 IGKV3-20P01619 116 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 VCX2Q9H322 139 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 MDFICQ9P1T7 246 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF56Q15929 161 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TEX29Q8N6K0 151 aa9.87□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM223A0PJW6 202 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 IGHV4-39P01824 125 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 PF4V1P10720 104 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TCF15Q12870 199 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 FOXC1Q12948 553 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 Q1RN00 199 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 A0A0J9YXV3 536 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 P0DMU3 169 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 FAM231AP0DMU4 169 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 FAM231CP0DMU5 169 aa9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM262E9PQX1 116 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 SVIPQ8NHG7 77 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 LGALS9O00182 355 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 LEPROTO15243 131 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 CRLF1O75462 422 aa9.85□□□□□ -0.83
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms