RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ERG28Q9UKR5 140 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ERCC8Q13216 396 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ITPR1Q14643 2758 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 A6NJY4 79 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF815PA8K554 130 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ODF3BA8MYP8 253 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB136Q30KP8 78 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 KIR2DL4Q99706 377 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 BLCAPP62952 87 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PDE6HQ13956 83 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01559Q495D7 138 aa8.57□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TSPAN13O95857 204 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 F8VRH5 84 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 H7C1H1 209 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRY2O43597 315 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF182Q8N6D2 247 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 CD7P09564 240 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 GAGE5Q13069 117 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 GAGE6Q13070 117 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N9W7 124 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 RAX2Q96IS3 184 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01587Q99440 93 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 A8MWV9 139 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 Q1RN00 199 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TEN1Q86WV5 123 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 CARD19Q96LW7 228 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00477Q96M19 166 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-53P01767 116 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 NPBQ8NG41 125 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LY6LH3BQJ8 138 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 CRYGBP07316 175 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 CFHR4Q92496 578 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 RELNP78509 3460 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TCL1BO95988 128 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAC2D3DTV9 90 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 H7C2G1 150 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.53□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LRBAP50851 2863 aa8.52□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01546A6NGU7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM262E9PQX1 116 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 STAB1Q9NY15 2570 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 KNCNA6PVL3 124 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 AVPP01185 164 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.52□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 SNCGO76070 127 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 PRSS2P07478 247 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF575Q86XF7 245 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 NRACQ8N912 160 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 CNFNQ9BYD5 112 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 GAGE2BQ13066 116 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 GAGE2EQ4V326 116 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 CFAP161Q6P656 301 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 TTC32Q5I0X7 151 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 C9JAW5 83 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB1P60022 68 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 VCX2Q9H322 139 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 STHQ8IWL8 128 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 C3orf56Q8N813 242 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0U1RRA0 63 aa8.49□□□□□ -1.05
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