RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 IL5P05113 134 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCYAP1P18509 176 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CNBPP62633 177 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRNQ5BIV9 151 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 S100A7L2Q5SY68 101 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CASC2Q6XLA1 102 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZSA8 131 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8N8P6 123 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF563Q8TA94 476 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TSKUQ8WUA8 353 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTSSAQ969W0 71 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 Q96M85 177 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 VAMP8Q9BV40 100 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SPANXDQ9BXN6 97 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00312Q9Y6C7 94 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS12P58397 1594 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC285556D6RIA3 1793 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LTN1O94822 1766 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CR1P17927 2039 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO3AQ8NEV4 1616 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM5DQ9BY66 1539 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf71Q711Q0 1435 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MYOFQ9NZM1 2061 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SCN7AQ01118 1682 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV10A0A0B4J240 114 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ERC2-IT1O76042 136 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SNCGO76070 127 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 FREM3P0C091 2139 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PIRTP0C851 137 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf137Q5JT78 98 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A26Q70HW3 274 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 AQP10Q96PS8 301 aa1.14□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 DLG5Q8TDM6 1919 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NRXN2Q9P2S2 1712 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF14Q15058 1648 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZGRF1Q86YA3 2104 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV17A0A0B4J275 112 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB6O95139 128 aa1.13□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 IGLC1P0CG04 106 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 SBSPONQ8IVN8 264 aa1.13□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 DYNLRB2Q8TF09 96 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C4orf3Q8WVX3 66 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 DPY30Q9C005 99 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA12Q9UI09 145 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH15Q96QU1 1955 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ESPL1Q14674 2120 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 DLEC1Q9Y238 1755 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 DAPK1P53355 1430 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP162Q5TB80 1403 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAPERQ9BY12 1400 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMA4Q16363 1823 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVK-7P63135 1459 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PXDNQ92626 1479 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTBP11277 2137 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 IQGAP3Q86VI3 1631 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM24AA6NFZ4 105 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NUPR1O60356 82 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CXCL8P10145 99 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PIPP12273 146 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 IL7P13232 177 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 COX7CP15954 63 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SNCAP37840 140 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM3P98179 157 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MIR22HGQ0VDD5 57 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 RHOHQ15669 191 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf55Q5SWW7 151 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf73Q69YU5 71 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C5orf38Q86SI9 138 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB119Q8N690 84 aa1.12□□□□□ -2.23
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