RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR25Q96S07 402 aa8.26□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6LH3BQJ8 138 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATOX1O00244 68 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYNX1P0DP58 116 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLRB1Q12918 225 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 RHOHQ15669 191 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C17orf77Q96MU5 243 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 AVPP01185 164 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00643Q86TS7 51 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAGE3Q14657 143 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRK1Q8WUW1 75 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRORYQ9H606 182 aa8.25□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01546A6NGU7 62 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIAP1O43715 76 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD40P25942 277 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-23P01705 113 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 GP9P14770 177 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.24□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C17orf100A8MU93 164 aa8.23□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX7A1P24310 79 aa8.23□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.23□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLEC2BQ92478 149 aa8.23□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTA1P02549 2419 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C5orf38Q86SI9 138 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 C16orf92Q96LL3 132 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEMTQ9UBM1 199 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS33Q8NF86 280 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 UPK3BQ9BT76 320 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.22□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM178BH3BS89 294 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BT86 120 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 SH2D1AO60880 128 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 BSPH1Q075Z2 132 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01600Q96MT4 127 aa8.21□□□□□ -1.09
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R3E3 92 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.21□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFB3O43676 98 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-23P01764 117 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACYP1P07311 99 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 FHL2Q14192 279 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERP2Q8N6R1 65 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 NRACQ8N912 160 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.2□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPC2P61916 151 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERCC8Q13216 396 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLGLAQ15195 96 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 RETNQ9HD89 108 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 AKAP6Q13023 2319 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF292O60281 2723 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 LY6HO94772 140 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS2P07478 247 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNJ2BPP57105 145 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 THAP8Q8NA92 274 aa8.19□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFHX3Q15911 3703 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXCL5P42830 114 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.18□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WVE0 104 aa8.17□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0B4J2C4 111 aa8.17□□□□□ -1.1
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