RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.94□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 SYT8Q8NBV8 401 aa12.94□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 LYRM9A8MSI8 78 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 NTF3P20783 257 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 TCTAP57738 103 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 MUC4Q99102 2169 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 APLNQ9ULZ1 77 aa12.93□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GXF2 115 aa12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 RIGQ13278 110 aa12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 DKK2Q9UBU2 259 aa12.92□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GW15 77 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 SSTP61278 116 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 TWIST1Q15672 202 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZTI0 123 aa12.91□□□□□ -0.34
PTX4-201ENST00000293922 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.89□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.89□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 HBBP68871 147 aa12.89□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 RASL11AQ6T310 242 aa12.89□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 C18orf15Q96N68 181 aa12.89□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 TRGC1P0CF51 173 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 AP1S3Q96PC3 154 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 DNAH2Q9P225 4427 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GAGE12BA1L429 117 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 A8MWV9 139 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GAGE7O76087 117 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 S100A8P05109 93 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GAGE12FP0CL80 117 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GAGE12GP0CL81 117 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GAGE12IP0CL82 117 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 GATD1Q8NB37 220 aa12.88□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 CAMPP49913 170 aa12.87□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 JPT2Q9H910 190 aa12.87□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 RS1O15537 224 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 DEFB130BP0DP73 79 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 DEFB130AP0DP74 79 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 EVI2AP22794 236 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 FAM210BQ96KR6 192 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.86□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 COLCA2A8K830 154 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 CRYGDP07320 174 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 COX19Q49B96 90 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.85□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 DAD1P61803 113 aa12.84□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.84□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.84□□□□□ -0.35
PTX4-201ENST00000293922 LINC00315P59091 139 aa12.83□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.83□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 OR4C5Q8NGB2 326 aa12.83□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.83□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.83□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 A0A087WWL8 130 aa12.82□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 RHODO00212 210 aa12.82□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 CIDEAO60543 219 aa12.82□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 SMIM17P0DL12 118 aa12.82□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.82□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 ZNF479Q96JC4 524 aa12.81□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 HLA-DQA1P01909 254 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 MT-ND6P03923 174 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 RAB4BP61018 213 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 AMN1Q8IY45 258 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 RNF185Q96GF1 192 aa12.8□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-53P01767 116 aa12.79□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 DNAH17Q9UFH2 4485 aa12.79□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 RAB4AP20338 218 aa12.79□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 RAB5AP20339 215 aa12.79□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.78□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 ATP5G1P05496 136 aa12.78□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 MGPP08493 103 aa12.78□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 HTN3P15516 51 aa12.78□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 NACAE9PAV3 2078 aa12.77□□□□□ -0.36
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.77□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 SLAQ13239 276 aa12.77□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 FHL2Q14192 279 aa12.77□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 ZNF56Q15929 161 aa12.77□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 FRZBQ92765 325 aa12.77□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 P0DMU3 169 aa12.76□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 FAM231AP0DMU4 169 aa12.76□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 FAM231CP0DMU5 169 aa12.76□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZSN1 163 aa12.76□□□□□ -0.37
PTX4-201ENST00000293922 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms