RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 HTN1P15515 57 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 VCX2Q9H322 139 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 FLNCQ14315 2725 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 CITED1Q99966 193 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 MTORP42345 2549 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXB13-201ENST00000290295 C9JAW5 83 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IFITM1P13164 125 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF575Q86XF7 245 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 Q1RN00 199 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 ACANP16112 2415 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 TCL1BO95988 128 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 MEIG1Q5JSS6 88 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 AJUBAQ96IF1 538 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 RAX2Q96IS3 184 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 M0R381 172 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 EBI3Q14213 229 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV4-59P01825 116 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 ID1P41134 155 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 NRACQ8N912 160 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 PRAC2D3DTV9 90 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 BUB3O43684 328 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SLC25A16P16260 332 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 EMP1P54849 157 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 Q8N6K4 173 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 TRBV12-3P01733 135 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 MGPP08493 103 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 F5H697 171 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 CRLF1O75462 422 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2D1P51668 147 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2D3P61077 147 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2D2P62837 147 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 CCDC140Q96MF4 163 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SLC25A20O43772 301 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 DEFB1P60022 68 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 FAM223BA6NKX1 122 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 DSCR9P59020 149 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 Q6ZQT7 251 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 RHODO00212 210 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IGHG4P01861 327 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.96□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.96□□□□□ -0.81
HOXB13-201ENST00000290295 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SPRY2O43597 315 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 F8W735 103 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 F6UB75 175 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 Q6ZS46 218 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 USMG5Q96IX5 58 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 BRI3O95415 125 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 CD7P09564 240 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 AVPP01185 164 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TOMM6Q96B49 74 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SYNJ2BPP57105 145 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 BAALCQ8WXS3 180 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms