RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 PDE6HQ13956 83 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 F5H697 171 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 NUP37Q8NFH4 326 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-201ENST00000272602 FCN3O75636 299 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 HERVK_113P61574 105 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZQT7 251 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 PIFOQ8TCI5 191 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM262E9PQX1 116 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CARD19Q96LW7 228 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV3-11P01762 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS2P07478 247 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00311Q8N616 119 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NOTCH1P46531 2555 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A20O43772 301 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 LINC01559Q495D7 138 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.32□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE12JA6NER3 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NBR2O15453 112 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE7O76087 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE12FP0CL80 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE12GP0CL81 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE12IP0CL82 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 GAGE4Q13068 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.31□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC179H3BU77 68 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NDPQ00604 133 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.3□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CFAP161Q6P656 301 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 HIVEP1P15822 2718 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C16orf92Q96LL3 132 aa8.29□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 H3BUX3 64 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 SAA4P35542 130 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 VCX2Q9H322 139 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 IFITM1P13164 125 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CRYGBP07316 175 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 PF4V1P10720 104 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB1P60022 68 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NRACQ8N912 160 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 BAALCQ8WXS3 180 aa8.28□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf86A6NJI1 115 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 Q6ZS46 218 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 DPM3Q9P2X0 92 aa8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 NPC2P61916 151 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV1-47P01700 117 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 AJUBAQ96IF1 538 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.27□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 VPS13CQ709C8 3753 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 CRLF1O75462 422 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 C15orf32Q32M92 178 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 RASL10AQ92737 203 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 A4D1N5 150 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 CFC1BP0CG36 223 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 CFC1P0CG37 223 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 DUX3Q96PT4 197 aa8.26□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.25□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.25□□□□□ -1.09
CNGA3-201ENST00000272602 IGF1P05019 195 aa8.25□□□□□ -1.09
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