RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029476.8

Sec22b-201, Transcript of Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sec22b, Length 2,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm9602J3QPD5 205 aa9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Srsf6Q3TWW8 339 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cd33Q63994 403 aa9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr470Q8VF65 314 aa9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CnmdQ9Z1F6 334 aa9.52□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav6n-5A0A075B621 112 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Wdr86D3Z757 380 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm3072F6SKY8 209 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ascl5M0QWB7 188 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 RhobP62746 196 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Defb28Q3V2L0 89 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dnd1Q6VY05 352 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gpr6Q6YNI2 363 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1434Q7TQR9 312 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Prickle3Q80VL3 624 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trbv3A0A0A6YYE2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm45844A0A1B0GRQ2 137 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zfp930A0A1D5RM15 441 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Degs1O09005 323 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Evi2aP20934 223 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 MiaQ61865 130 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ubald1Q6P3B2 176 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Bricd5Q8BV89 174 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Spsb4Q8R5B6 273 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Necap1Q9CR95 275 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ccl28Q9JIL2 130 aa9.51□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm28171A0A087WQ19 227 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 A930017K11RikE0CXQ2 571 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm21789J3QMZ1 123 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm21870J3QPN2 123 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm21883J3QPV3 123 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Bcat2O35855 393 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PigyP0C1P0 71 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Defa-rs2P17534 91 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rom1P32958 351 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Q3U1D9 316 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Foxc2Q61850 494 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr263Q7TQT8 317 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam168aQ8BGZ2 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Harbi1Q8BR93 349 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rnf125Q9D9R0 233 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr894Q9EQB2 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mbnl1Q9JKP5 341 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ighv5-4A0A075B5P9 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm4565A0A140LJ87 301 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1436A0PK57 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1104A2AVB5 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm5741B2RVA4 72 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6176J3QK59 301 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Shisal1Q0VBP7 198 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Asphd1Q2TA57 360 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm10384Q3UQ87 92 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm4567Q3UTA8 301 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 SvipQ3UZP4 77 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm10840Q3V2K9 103 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ercc8Q8CFD5 397 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Habp2Q8K0D2 558 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr262Q8VFV8 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr513Q8VFZ3 309 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Kiaa1549Q68FD9 1940 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav6n-7A0A075B6A6 116 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cr2P19070 1025 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Col8a2P25318 699 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gcm1P70348 436 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1465Q7TQR2 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Q8C3M9 231 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Alkbh6Q8K2U2 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dram1Q9DC58 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 G6pc2Q9Z186 355 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa9.5□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Psg18B2RSG7 476 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr466E9Q2B9 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm21882J3QN86 361 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mtnd6P03925 172 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Prrx1P63013 245 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Neurog3P70661 214 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 B020031M17RikQ3UT11 173 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1178Q7TR20 323 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm4894Q8CA09 118 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CrhQ8CIT0 187 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hoxc12Q8K5B8 280 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r222Q8R269 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr984Q8VFN1 314 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Prss37Q9DAA4 237 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Egr4Q9WUF2 478 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav17A0A075B655 113 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav7-4A0A075B6C1 113 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa9.49□□□□□ -0.89
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rnf212F6TQD1 307 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.7 ms