Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CnmdQ9Z1F6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CnmdQ9Z1F6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CnmdQ9Z1F6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CnmdQ9Z1F6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CnmdQ9Z1F6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CnmdQ9Z1F6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CnmdQ9Z1F6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CnmdQ9Z1F6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CnmdQ9Z1F6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CnmdQ9Z1F6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CnmdQ9Z1F6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CnmdQ9Z1F6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CnmdQ9Z1F6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CnmdQ9Z1F6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CnmdQ9Z1F6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CnmdQ9Z1F6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CnmdQ9Z1F6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CnmdQ9Z1F6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CnmdQ9Z1F6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CnmdQ9Z1F6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CnmdQ9Z1F6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CnmdQ9Z1F6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CnmdQ9Z1F6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CnmdQ9Z1F6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CnmdQ9Z1F6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CnmdQ9Z1F6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CnmdQ9Z1F6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CnmdQ9Z1F6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CnmdQ9Z1F6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CnmdQ9Z1F6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CnmdQ9Z1F6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CnmdQ9Z1F6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CnmdQ9Z1F6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CnmdQ9Z1F6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CnmdQ9Z1F6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CnmdQ9Z1F6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CnmdQ9Z1F6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CnmdQ9Z1F6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CnmdQ9Z1F6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CnmdQ9Z1F6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CnmdQ9Z1F6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CnmdQ9Z1F6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CnmdQ9Z1F6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CnmdQ9Z1F6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CnmdQ9Z1F6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CnmdQ9Z1F6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CnmdQ9Z1F6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CnmdQ9Z1F6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnmdQ9Z1F6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnmdQ9Z1F6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CnmdQ9Z1F6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CnmdQ9Z1F6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CnmdQ9Z1F6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CnmdQ9Z1F6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CnmdQ9Z1F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CnmdQ9Z1F6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CnmdQ9Z1F6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CnmdQ9Z1F6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CnmdQ9Z1F6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CnmdQ9Z1F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CnmdQ9Z1F6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnmdQ9Z1F6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnmdQ9Z1F6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnmdQ9Z1F6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnmdQ9Z1F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CnmdQ9Z1F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnmdQ9Z1F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnmdQ9Z1F6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnmdQ9Z1F6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnmdQ9Z1F6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnmdQ9Z1F6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CnmdQ9Z1F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CnmdQ9Z1F6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CnmdQ9Z1F6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CnmdQ9Z1F6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CnmdQ9Z1F6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CnmdQ9Z1F6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CnmdQ9Z1F6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CnmdQ9Z1F6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CnmdQ9Z1F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CnmdQ9Z1F6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CnmdQ9Z1F6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CnmdQ9Z1F6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnmdQ9Z1F6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CnmdQ9Z1F6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CnmdQ9Z1F6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CnmdQ9Z1F6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CnmdQ9Z1F6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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