Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RhobP62746 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RhobP62746 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RhobP62746 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RhobP62746 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RhobP62746 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RhobP62746 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RhobP62746 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RhobP62746 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RhobP62746 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RhobP62746 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RhobP62746 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RhobP62746 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RhobP62746 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RhobP62746 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RhobP62746 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RhobP62746 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RhobP62746 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RhobP62746 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RhobP62746 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhobP62746 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhobP62746 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RhobP62746 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhobP62746 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RhobP62746 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RhobP62746 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RhobP62746 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RhobP62746 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhobP62746 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RhobP62746 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RhobP62746 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RhobP62746 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RhobP62746 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RhobP62746 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RhobP62746 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhobP62746 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RhobP62746 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhobP62746 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhobP62746 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhobP62746 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhobP62746 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RhobP62746 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RhobP62746 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RhobP62746 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RhobP62746 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RhobP62746 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RhobP62746 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RhobP62746 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RhobP62746 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RhobP62746 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RhobP62746 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RhobP62746 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RhobP62746 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RhobP62746 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RhobP62746 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RhobP62746 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RhobP62746 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhobP62746 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RhobP62746 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhobP62746 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhobP62746 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhobP62746 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhobP62746 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhobP62746 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhobP62746 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RhobP62746 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhobP62746 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhobP62746 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhobP62746 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhobP62746 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhobP62746 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhobP62746 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhobP62746 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhobP62746 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhobP62746 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhobP62746 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhobP62746 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhobP62746 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhobP62746 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhobP62746 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RhobP62746 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhobP62746 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhobP62746 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhobP62746 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhobP62746 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhobP62746 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhobP62746 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhobP62746 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhobP62746 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RhobP62746 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhobP62746 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhobP62746 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhobP62746 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhobP62746 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RhobP62746 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhobP62746 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhobP62746 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhobP62746 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RhobP62746 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhobP62746 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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