RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 GTSF1Q8WW33 167 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 TPPP3Q9BW30 176 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 IL36BQ9NZH7 164 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 CXorf65A6NEN9 183 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 A8MWL6 223 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 M0R2P5 195 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SNAI2O43623 268 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SPINK4O60575 86 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DEFB130BP0DP73 79 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DEFB130AP0DP74 79 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C12orf74Q32Q52 190 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 TSKUQ8WUA8 353 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SPXQ9BT56 116 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 JPT2Q9H910 190 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 XKRY2A2RUG3 117 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 LYRM9A8MSI8 78 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 M0R381 172 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MT-ND4LP03901 98 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MED14OSP0DP75 135 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF876PQ49A33 203 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 CT83Q5H943 113 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV3-53P01767 116 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 OR5AL1P0C617 328 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 DAD1P61803 113 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZTC4 211 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 RASL10AQ92737 203 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 HIGD1CA8MV81 97 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 PPP1R2P9O14990 202 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 CTRLP40313 264 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 NUP35Q8NFH5 326 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1W2PPQ1 181 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 F2Z2F3 143 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 RS1O15537 224 aa7.25□□□□□ -1.25
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ITGB5-211ENST00000608107 PTH2Q96A98 100 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 A0A087WWL8 130 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 FAM231BA6NCW3 169 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB5-211ENST00000608107 RHEBQ15382 184 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB5-211ENST00000608107 SYT8Q8NBV8 401 aa7.24□□□□□ -1.25
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ITGB5-211ENST00000608107 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 A0A087WWC5 75 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.23□□□□□ -1.25
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ITGB5-211ENST00000608107 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 CNFNQ9BYD5 112 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1B0GUT8 65 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 F5H768 121 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 ATP5G1P05496 136 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 EVI2AP22794 236 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 WDR73Q6P4I2 378 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZSN1 163 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 C18orf15Q96N68 181 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-211ENST00000608107 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.22□□□□□ -1.25
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