RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE12BA1L429 117 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 SNURFLB1AK76 121 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 F6UZH7 168 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM250H0YL14 139 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX46H3BTG2 121 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 PDE6DO43924 150 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE7O76087 117 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GCGP01275 180 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 IFNA7P01567 189 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE12FP0CL80 117 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE12GP0CL81 117 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE12IP0CL82 117 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5I1Q13606 314 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 SMUG1Q53HV7 270 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 SGK494Q96LW2 274 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 MDFICQ9P1T7 246 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 GNG13Q9P2W3 67 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 VAX2Q9UIW0 290 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 PKD1P98161 4303 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-210ENST00000588340 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 H3BNG1 76 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 NXPH4O95158 308 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 TYMSP04818 313 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXA5P20719 270 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 AKR1C3P42330 323 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 CCL18P55774 89 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 CST9LP1Q5W188 147 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZTI0 123 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 PRNTQ86SH4 94 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNS1Q96KK3 526 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SPXQ9BT56 116 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 DERL1Q9BUN8 251 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 HERC2O95714 4834 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0J9YY99 117 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A1B0GV50 99 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 C9JCJ5 164 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 IFNA1P01562 189 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF415Q09FC8 603 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM210AQ96ND0 272 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 IL36BQ9NZH7 164 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 M0R2P5 195 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 GNRH2O43555 120 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SH2D1AO60880 128 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 MED14OSP0DP75 135 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2G1P62253 170 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 IFITM2Q01629 132 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 MUC21Q5SSG8 566 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 BAGE2Q86Y30 109 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SNAI2O43623 268 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5AL1P0C617 328 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 ESRGQ1W209 222 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 CENPWQ5EE01 88 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 C6orf223Q8N319 242 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 Q9H8V8 135 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 C9JQL5 133 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 RS1O15537 224 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 CIDEAO60543 219 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLC6P0CF74 106 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00694P0DN24 101 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FHL2Q14192 279 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 UPK3BQ9BT76 320 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 CNFNQ9BYD5 112 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 PARLQ9H300 379 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.9 ms