RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5SQ99766 215 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WXM4 84 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 CD300CQ08708 224 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 BTN1A1Q13410 526 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZSA8 131 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD7Q86VX2 200 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 Q9HAA7 133 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MCUBQ9NWR8 336 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf202A1L168 122 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 COX7A2P2O60397 106 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SCO1O75880 301 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 ERCC8Q13216 396 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SIGMAR1Q99720 223 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 PSENENQ9NZ42 101 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 KLLNB2CW77 178 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 B5MCH6 92 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 H3BQ15 152 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 K7EPK0 472 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 GPX1P07203 203 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SFTA3P0C7M3 94 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGLC2P0DOY2 106 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 OPCMLQ14982 345 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 BLNKQ8WV28 456 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00477Q96M19 166 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 C9JCJ5 164 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 FNDC10F2Z333 226 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 M0R143 59 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MORN5Q5VZ52 161 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SCXQ7RTU7 201 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MRAP2Q96G30 205 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TM2D2Q9BX73 214 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 M0R3E3 92 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 AGPAT2O15120 278 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SFT2D2O95562 160 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM18P0DKX4 95 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TNFSF8P32971 234 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE5Q13069 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE6Q13070 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 RNF213Q63HN8 5207 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0A0MQY5 61 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 F6UZH7 168 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SSSCA1O60232 199 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF253O75346 499 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5LO75964 103 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-30P01768 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-33P01772 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 NMBP08949 121 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 CRISP2P16562 243 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2V1Q13404 147 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 WFDC2Q14508 124 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 CTF1Q16619 201 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TDRG1Q3Y452 100 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZQT7 251 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM8Q96KF7 97 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 PSG8Q9UQ74 426 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 FAM74A7A6NL05 159 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LECT2O14960 151 aa6.02□□□□□ -1.45
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