RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.29□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 MUC4Q99102 2169 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GNRH2O43555 120 aa7.28□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 AMBPP02760 352 aa7.28□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 RIPPLY3P57055 190 aa7.27□□□□□ -1.25
GDE1-205ENST00000569899 SSTP61278 116 aa7.27□□□□□ -1.25
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GDE1-205ENST00000569899 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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GDE1-205ENST00000569899 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-205ENST00000569899 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.22□□□□□ -1.25
GDE1-205ENST00000569899 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GDE1-205ENST00000569899 NOTCH1P46531 2555 aa7.21□□□□□ -1.25
GDE1-205ENST00000569899 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.21□□□□□ -1.26
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