RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NXPH4O95158 308 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASIPP42127 132 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTAP01374 205 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKR1C3P42330 323 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB5CP51148 216 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNLZQ5SXM8 178 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL36BQ9NZH7 164 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4DEV8 164 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7EP13 123 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 A8MWV9 139 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED14OSP0DP75 135 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIRAPP58753 221 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNP2Q05952 138 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOHQ15669 191 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX46H3BTG2 121 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH2D1AO60880 128 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRIP1P50238 77 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 MANBALQ9NQG1 85 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1QBP02746 253 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC01559Q495D7 138 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZNX1 250 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT8Q8NBV8 401 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GV50 99 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BVH4 76 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0R036 132 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00315P59091 139 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC51BQ86UW2 128 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARLQ9H300 379 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHODO00212 210 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVI2AP22794 236 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SULT1A2P50226 295 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFE4Q86UQ8 179 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAGE2Q86Y30 109 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLST8Q9BVC4 326 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNG13Q9P2W3 67 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCL1P09341 107 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP14Q86UN6 197 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 C11orf52Q96A22 123 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP82Q8N141 532 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNA1P01562 189 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL20P78556 96 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF575Q86XF7 245 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 SFRP2Q96HF1 295 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 C16orf90A8MZG2 172 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE6DO43924 150 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 LELP1Q5T871 98 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRYGDP07320 174 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZSN1 163 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM12Q96EX1 92 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 JPT2Q9H910 190 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0R381 172 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 272.4 ms