RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.2□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 BATF3Q9NR55 127 aa7.2□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 RNF222A6NCQ9 220 aa7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 GCSHP23434 173 aa7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 ZFP69Q49AA0 526 aa7.19□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.19□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 PRNTQ86SH4 94 aa7.19□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00479Q96M42 142 aa7.18□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.17□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 PARLQ9H300 379 aa7.17□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.17□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 A8MWV9 139 aa7.16□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.16□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 Q8N814 137 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 FRZBQ92765 325 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IL36BQ9NZH7 164 aa7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 G3V3Q6 166 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 PEX7O00628 323 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-30P01768 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-33P01772 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PDXDC1-211ENST00000565362 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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PDXDC1-211ENST00000565362 UBE2G2P60604 165 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDXDC1-211ENST00000565362 Q86TA4 180 aa7.14□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.14□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 JPT2Q9H910 190 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDXDC1-211ENST00000565362 B4DEV8 164 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 C1QBP02746 253 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDXDC1-211ENST00000565362 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDXDC1-211ENST00000565362 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 TM2D2Q9BX73 214 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A087WWC5 75 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 H3BVH4 76 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 RHODO00212 210 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 FHITP49789 147 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 WFDC2Q14508 124 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.11□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 SH2D1AO60880 128 aa7.11□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC01559Q495D7 138 aa7.11□□□□□ -1.27
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.11□□□□□ -1.27
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