RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF688P0C7X2 276 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 DCANP1Q8TF63 244 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 DPF1Q92782 380 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 K7EP13 123 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.91■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 A0A096LNT2 108 aa15.9■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 RNF223E7ERA6 249 aa15.9■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 ZMAT4Q9H898 229 aa15.9■□□□□ 0.14
TMEM260-216ENST00000557657 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 IGKCP01834 107 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.89■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 PSMG4Q5JS54 123 aa15.88■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 K7EMI3 77 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 OR4C5Q8NGB2 326 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SYNJ2BPP57105 145 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 NF1P21359 2839 aa15.87■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 MRAP2Q96G30 205 aa15.86■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 PRSS47A8MTI9 375 aa15.86■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 RAB37Q96AX2 223 aa15.86■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 A0A087WWL8 130 aa15.85■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.85■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 DPM2O94777 84 aa15.85■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 APCP25054 2843 aa15.85■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 KLLNB2CW77 178 aa15.84■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 SLC25A16P16260 332 aa15.84■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.84■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 CD7P09564 240 aa15.83■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 AKAP9Q99996 3911 aa15.83■□□□□ 0.13
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 A0A087WW49 117 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 K7EMT4 169 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 ATP5LO75964 103 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 JMJD8Q96S16 334 aa15.83■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 GATA3P23771 443 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB136Q30KP8 78 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 OR9G4Q8NGQ1 327 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 DSCR9P59020 149 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00315P59091 139 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 HSD52Q0P140 79 aa15.82■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 FOSL1P15407 271 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 ID1P41134 155 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 AP1S3Q96PC3 154 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 CSTL1Q9H114 145 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 MDFICQ9P1T7 246 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 A0A087WX48 190 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 COX6B1P14854 86 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 SEC11AP67812 179 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 SCGB3A1Q96QR1 104 aa15.81■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 H3BUT2 72 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 GCSHP23434 173 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 FXYD2P54710 66 aa15.8■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 CR1P17927 2039 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 CHD6Q8TD26 2715 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 DUX3Q96PT4 197 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF702PQ9H963 129 aa15.79■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 K7ERJ3 54 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 SIVA1O15304 175 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF580Q9UK33 172 aa15.78■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.77■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 F5H697 171 aa15.77■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 TOMM6Q96B49 74 aa15.77■□□□□ 0.12
TMEM260-216ENST00000557657 A0A0J9YX75 114 aa15.77■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.77■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 C20orf78Q9BR46 151 aa15.77■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 K7EQG2 157 aa15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 PRM2P04554 102 aa15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 MED14OSP0DP75 135 aa15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 EMP1P54849 157 aa15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 ORMDL2Q53FV1 153 aa15.76■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 ITPR3Q14573 2671 aa15.75■□□□□ 0.11
TMEM260-216ENST00000557657 SLURP1P55000 103 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms