RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.81□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 MDFICQ9P1T7 246 aa8.81□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BKO60814 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BJP06899 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BOP23527 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BBP33778 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BDP58876 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP10-11P60412 298 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BCP62807 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF415Q09FC8 603 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 SLAQ13239 276 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 C9orf85Q96MD7 179 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.8□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 G3V4G9 280 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 PRM2P04554 102 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 S100A6P06703 90 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFA6P56556 154 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 SYT8Q8NBV8 401 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 APOC4P55056 127 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 AMN1Q8IY45 258 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SRIP30626 198 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RCHY1Q96PM5 261 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 NXPH4O95158 308 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 AZU1P20160 251 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 EVI2AP22794 236 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 AP1S3Q96PC3 154 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RIPPLY3P57055 190 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SPXQ9BT56 116 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 STAB1Q9NY15 2570 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 MGPP08493 103 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM17P0DL12 118 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RAB4AP20338 218 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RRN3P1Q2M238 152 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF876PQ49A33 203 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RNF185Q96GF1 192 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 VWFP04275 2813 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 M0R2P5 195 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 C16orf74Q96GX8 76 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 JPT2Q9H910 190 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 D6R8Y8 96 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 SMKR1H3BMG3 65 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2CO00762 179 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 CKS2P33552 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 BAGE3Q86Y29 109 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 MUC4Q99102 2169 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 COL6A5A8TX70 2615 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 NCR2O95944 276 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 IQCJQ1A5X6 159 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB135Q30KP9 77 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 ORMDL3Q8N138 153 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 PTH2Q96A98 100 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 PRELID3AQ96N28 172 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WWL8 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 PPBPP02775 128 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 Q0VG73 95 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 IL17DQ8TAD2 202 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 U3KQK5 164 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRR-209ENST00000549308 C5orf52A6NGY3 159 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 A8MZ25 164 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 MRAP2Q96G30 205 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms