RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 ARL3P36405 182 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 RELNP78509 3460 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFS8O00217 210 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 NXPH4O95158 308 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB1P60022 68 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 SCGB2A2Q13296 93 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01549A6NIU2 74 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFA4O00483 81 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 GNRH2O43555 120 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TSHBP01222 138 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 LMO4P61968 165 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV12-3P01733 135 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 CD7P09564 240 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00315P59091 139 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM219Q86XT9 240 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WW49 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 APOMO95445 188 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TSPAN13O95857 204 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 CACNA1BQ00975 2339 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 IGIPA6NJ69 53 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 C11orf86A6NJI1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 NBL1P41271 181 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2D3P61077 147 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2D2P62837 147 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 FOXC1Q12948 553 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 FOXI1Q12951 378 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 MED13LQ71F56 2210 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0J9YY99 117 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 F6UB75 175 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 HERVK_113P61574 105 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 PMVKQ15126 192 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM141Q96I45 108 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRK-217ENST00000524534 BRI3O95415 125 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 PSMB2P49721 201 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 NFE4Q86UQ8 179 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SPTBN2O15020 2390 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 KLLNB2CW77 178 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TIMM17AQ99595 171 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CDIP1Q9H305 208 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 VCYO14598 125 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 EMP1P54849 157 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 KLRB1Q12918 225 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 USMG5Q96IX5 58 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-30P01768 117 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SYT8Q8NBV8 401 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 JPT2Q9H910 190 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 MUC4Q99102 2169 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 H3BUA1 57 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SFTA2Q6UW10 78 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZS46 218 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 AMELXQ99217 191 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV3-11P01762 117 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CFC1BP0CG36 223 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 CFC1P0CG37 223 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF876PQ49A33 203 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.61□□□□□ -1.03
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