RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 YPEL4Q96NS1 127 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 M0R2Z0 102 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 AMBPP02760 352 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RIGQ13278 110 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF124Q15973 351 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 PRR9Q5T870 116 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 NUP35Q8NFH5 326 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RCHY1Q96PM5 261 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 AGRNO00468 2067 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GUT8 65 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 KLLNB2CW77 178 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ASIPP42127 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SSTP61278 116 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 COX19Q49B96 90 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 MUC21Q5SSG8 566 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 GTSF1Q8WW33 167 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FRZBQ92765 325 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 KCNS1Q96KK3 526 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 F2Z2F3 143 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 INSP01308 110 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TYMSP04818 313 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 HOXA5P20719 270 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 S100A2P29034 98 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 HBBP68871 147 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 AMTNQ6UX39 209 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SPATA25Q9BR10 227 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RETNQ9HD89 108 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.8□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GW15 77 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 F8WDY8 70 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 HTN1P15515 57 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TWIST1Q15672 202 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RASL11AQ6T310 242 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6ZQT7 251 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ZFP82Q8N141 532 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 NIT2Q9NQR4 276 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 XCL2Q9UBD3 114 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TENM2Q9NT68 2774 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 CBY3A6NI87 242 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 A8MTW9 85 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SNURFLB1AK76 121 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SPRY2O43597 315 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 APCSP02743 223 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 MT-ND6P03923 174 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRGC2P03986 189 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 CACNG7P62955 275 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01587Q99440 93 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.78□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 H3BVH4 76 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 GNRH2O43555 120 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 TRIAP1O43715 76 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 HLA-DQA1P01909 254 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 CTRLP40313 264 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.77□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.76□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 F5H697 171 aa6.76□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLC6P0CF74 106 aa6.76□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.76□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.76□□□□□ -1.33
TSPAN18-208ENST00000520837 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms