RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01545Q5VT33 79 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 GATD1Q8NB37 220 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIR2DL4Q99706 377 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS25Q9BRG1 176 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 EPDR1Q9UM22 224 aa2.97□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAMA1P25391 3075 aa2.96□□□□□ -1.93
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 CACNA1DQ01668 2161 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGPA6NDG6 321 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 E7EUB6 86 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LY6LH3BQJ8 138 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BRM9 83 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7ERU9 68 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 NPFFO15130 113 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNG7O60262 68 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LEPROTL1O95214 131 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV3-48P01763 117 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRB1P04280 392 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGF1P05019 195 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PYYP10082 97 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGF6P10767 208 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEC11AP67812 179 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 HBBP68871 147 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 WT1-ASQ06250 92 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 NPBQ8NG41 125 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR82Q96P67 336 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRGV9Q99603 122 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACACAQ13085 2346 aa2.96□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 DSCAMO60469 2012 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 FRYQ5TBA9 3013 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 APC2O95996 2303 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 C7orf71A4D174 169 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 ODF3BA8MYP8 253 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 B4DSR2 109 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 SIVA1O15304 175 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTAP01374 205 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRYGCP07315 174 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRYGBP07316 175 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LYZP61626 148 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNG5P63218 68 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 BLNKQ8WV28 456 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARPC1AQ92747 370 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYO18BQ8IUG5 2567 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7EP34 96 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 K7EQM0 130 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFA3O95167 84 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 NCR2O95944 276 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 P01737 135 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGHV1-69P01742 117 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCRAP04437 139 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 MSMBP08118 114 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A16P16260 332 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF138P52744 262 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 RIPPLY3P57055 190 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLP1P60201 277 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 EBI3Q14213 229 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAGE3Q14657 143 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.94□□□□□ -1.94
TIMMDC1-209ENST00000498399 FMC1Q96HJ9 113 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms