RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 M0R2P5 195 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 LRBAP50851 2863 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 CD3EP07766 207 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 EBI3Q14213 229 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 PSMG4Q5JS54 123 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 CLEC2BQ92478 149 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 TIMD4Q96H15 378 aa6.54□□□□□ -1.36
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VWA3B-220ENST00000495571 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.54□□□□□ -1.36
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VWA3B-220ENST00000495571 TSHBP01222 138 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.53□□□□□ -1.36
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VWA3B-220ENST00000495571 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 COL12A1Q99715 3063 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 H3BRN7 92 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-23P01764 117 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 RNF182Q8N6D2 247 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.53□□□□□ -1.36
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VWA3B-220ENST00000495571 HES1Q14469 280 aa6.52□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.52□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 Q1RN00 199 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf82Q6UX34 121 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 hADV29S1A0JD25 119 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 RNF223E7ERA6 249 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 I3L2K1 104 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LHBP01229 141 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 CD40P25942 277 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 MED13LQ71F56 2210 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 TEX22C9J3V5 150 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 F5H768 121 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 WIPF1O43516 503 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 HERVK_113P61574 105 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.51□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 CNFNQ9BYD5 112 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.51□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.5□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 RNF125Q96EQ8 232 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 ACACBO00763 2458 aa6.5□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 K7EIM0 57 aa6.49□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 C2orf48Q96LS8 159 aa6.49□□□□□ -1.37
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VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 ATXN8Q156A1 80 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 Q5XG85 94 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 RNF152Q8N8N0 203 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 APC2O95996 2303 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 ABCA4P78363 2273 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 AKAP6Q13023 2319 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 METTL26Q96S19 204 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.47□□□□□ -1.37
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