RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TMEM213A2RRL7 107 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12JA6NER3 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SH2D1AO60880 128 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE7O76087 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 APOMO95445 188 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRGV3P03979 118 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12FP0CL80 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12GP0CL81 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12IP0CL82 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE4Q13068 117 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TMEM189A5PLL7 270 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 H3BMG7 143 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRBV12-3P01733 135 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IGHG4P01861 327 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 BLCAPP62952 87 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZS46 218 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PRR25Q96S07 402 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 BUB3O43684 328 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 AVPP01185 164 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ORM1P02763 201 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FOXE3Q13461 319 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 AMTNQ6UX39 209 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 A8MZ25 164 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 INAFM1C9JVW0 142 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 COX8AP10176 69 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 NMUP48645 174 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RIGQ13278 110 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GAGE13Q4V321 117 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TTC32Q5I0X7 151 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 F8W1H4 67 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 METTL26Q96S19 204 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 KLK15Q9H2R5 256 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 HAX1O00165 279 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C3orf56Q8N813 242 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RAX2Q96IS3 184 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 K7ERJ3 54 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SRD5A1P18405 259 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 DEFB1P60022 68 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C5orf47Q569G3 176 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 AMN1Q8IY45 258 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 SMKR1H3BMG3 65 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 CCDC179H3BU77 68 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 OR5AL1P0C617 328 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FXYD7P58549 80 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZUT4 128 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 FCER1GP30273 86 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 TWIST1Q15672 202 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZQT7 251 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 GLMPQ8WWB7 406 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC4-211ENST00000492996 RNF223E7ERA6 249 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 NCR2O95944 276 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 XGP55808 180 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 D6R8Y8 96 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 C16orf92Q96LL3 132 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 PRELID3AQ96N28 172 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC4-211ENST00000492996 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.33□□□□□ -1.56
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