RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 GABARAPH6UMI1 98 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ARL6IP5O75915 188 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 JTBO76095 146 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 OR9G9P0C7N8 305 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 EBI3Q14213 229 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 KISS1Q15726 138 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 MUC21Q5SSG8 566 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 Q8N6K4 173 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 LRTM2Q8N967 370 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 C20orf78Q9BR46 151 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.57□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 KNCNA6PVL3 124 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 J3QLW9 94 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 K7EIL1 84 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PIGYQ3MUY2 71 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PRR15Q8IV56 129 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 RAB37Q96AX2 223 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TVP23CQ96ET8 276 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 NAA60Q9H7X0 242 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 NRN1Q9NPD7 142 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 DPM3Q9P2X0 92 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 CACNG5Q9UF02 275 aa4.56□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 H3BMG7 143 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TNFSF12O43508 249 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 DEDDO75618 318 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SNCGO76070 127 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLL1P15814 213 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HBG1P69891 147 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HBG2P69892 147 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 Q56UQ5 140 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 LEAP2Q969E1 77 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PRELID3AQ96N28 172 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TAS2R4Q9NYW5 299 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 CALYQ9NYX4 217 aa4.55□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 OOSP1A8MZH6 123 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 C8orf87E5RJ46 101 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PIN1P1O15428 100 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF253O75346 499 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PSMB3P49720 205 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF137PP52743 207 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00311Q8N616 119 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 OR9G1Q8NH87 305 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 OTORQ9NRC9 128 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 LYSTQ99698 3801 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF727A8MUV8 499 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 H3BUT2 72 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-7P01780 117 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HLA-DMBP28068 263 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 TAS2R45P59539 299 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 HERV-K104P61576 105 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 MSMO1Q15800 293 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 RTL8BQ17RB0 113 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 MPV17LQ2QL34 196 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 SP6Q3SY56 376 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.53□□□□□ -1.68
JMJD1C-208ENST00000490669 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms