RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.34□□□□□ -1.07
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C9orf3-220ENST00000489318 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.34□□□□□ -1.07
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C9orf3-220ENST00000489318 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.34□□□□□ -1.07
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C9orf3-220ENST00000489318 G3V4G9 280 aa8.33□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 ZFP82Q8N141 532 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.33□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.33□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 TRGC1P0CF51 173 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.32□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 ZNF415Q09FC8 603 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 TWIST1Q15672 202 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.32□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 AP1S3Q96PC3 154 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.31□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 M0R381 172 aa8.3□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SYT8Q8NBV8 401 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 RNF185Q96GF1 192 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 C16orf74Q96GX8 76 aa8.3□□□□□ -1.08
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C9orf3-220ENST00000489318 AMN1Q8IY45 258 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 U3KQK5 164 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 X6R8D5 127 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 M0R2P5 195 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SPRY2O43597 315 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 PRM2P04554 102 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 RAB4AP20338 218 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 EVI2AP22794 236 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SRIP30626 198 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZWC4 215 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 RCHY1Q96PM5 261 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-220ENST00000489318 PPBPP02775 128 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 HTN1P15515 57 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00315P59091 139 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 SSTP61278 116 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 Q0VG73 95 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 RRN3P1Q2M238 152 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.27□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 NACAE9PAV3 2078 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 C5orf52A6NGY3 159 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 ORMDL3Q8N138 153 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 MRAP2Q96G30 205 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.26□□□□□ -1.09
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