RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	HCP5	Q6MZN7	132 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	DPY30	Q9C005	99 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	RTTN	Q86VV8	2226 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	CASZ1	Q86V15	1759 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	LTBP2	Q14767	1821 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	C5orf38	Q86SI9	138 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164		Q9H521	79 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	AP4S1	Q9Y587	144 aa		2.84	□□□□□ -1.95
GIGYF2-238	ENST00000483164	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		2.84	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		2.84	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		2.84	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SSSCA1	O60232	199 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00032	P0C843	101 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	CBLN1	P23435	193 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	DSCR8	Q96T75	97 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	ANK1	P16157	1881 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	COL1A2	P08123	1366 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	MED12L	Q86YW9	2145 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRDM2	Q13029	1718 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADGRB3	O60242	1522 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	LRP5	O75197	1615 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PLXNA2	O75051	1894 aa		2.82	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164		A0A0J9YY99	117 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164		A6NIN4	97 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164		H3BRM9	83 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC25A6	P12236	298 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C22orf24	Q9Y442	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	IFT140	Q96RY7	1462 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	LAMB1	P07942	1786 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PTPRF	P10586	1907 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PTPRM	P28827	1452 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	INSL4	Q14641	139 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	MED14	O60244	1454 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	NUPR1	O60356	82 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		2.79	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	UBE2G1	P62253	170 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	DMAC1	Q96GE9	116 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	KDM6B	O15054	1643 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGHV3-30	P01768	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		2.77	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	RBAKDN	A6NC62	111 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	IL7	P13232	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
GIGYF2-238	ENST00000483164	VAMP8	Q9BV40	100 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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