RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476867.6

PRRX1-203, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-203ENST00000476867 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-203ENST00000476867 MANBALQ9NQG1 85 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-203ENST00000476867 MDFICQ9P1T7 246 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-203ENST00000476867 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-203ENST00000476867 H3BNG1 76 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 GCGP01275 180 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 P0DMU3 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 FAM231AP0DMU4 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 FAM231CP0DMU5 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 CCL20P78556 96 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 RASL10AQ92737 203 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 LYSTQ99698 3801 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 GNRH2O43555 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 LTAP01374 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 UBE2G1P62253 170 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 Q86TA4 180 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 GNG13Q9P2W3 67 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 NAGKQ9UJ70 344 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 A0A1B0GV50 99 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 M0R2P5 195 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PRYO14603 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TYMSP04818 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 CRIP1P50238 77 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 SLAQ13239 276 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 RNF212Q495C1 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PTH2Q96A98 100 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 MLST8Q9BVC4 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 IFNA1P01562 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 AKR1C3P42330 323 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 OR5I1Q13606 314 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 DNLZQ5SXM8 178 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 C11orf52Q96A22 123 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 VAX2Q9UIW0 290 aa6.68□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PDE6DO43924 150 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 CIDEAO60543 219 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 KRTAP10-2P60368 255 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 BAGE2Q86Y30 109 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 C9orf85Q96MD7 179 aa6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 SH2D1AO60880 128 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ORM1P02763 201 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 FHL2Q14192 279 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 SMIM12Q96EX1 92 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 IL36BQ9NZH7 164 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 PRO0255Q9UI72 69 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 MUC4Q99102 2169 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 B4DEV8 164 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 NUDT3O95989 172 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 BCL2P10415 239 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 CRYBA4P53673 196 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 CCL18P55774 89 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF876PQ49A33 203 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF575Q86XF7 245 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-203ENST00000476867 RYR3Q15413 4870 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 A0A0J9YY99 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 CXCL1P09341 107 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 ASIPP42127 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 ZNF479Q96JC4 524 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 C9JCJ5 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 RS1O15537 224 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 IGHV3-53P01767 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 DERL1Q9BUN8 251 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-203ENST00000476867 MED9Q9NWA0 146 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms