RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 VCYO14598 125 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 CDKN1BP46527 198 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 ERASQ7Z444 233 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8N2B8 174 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF702PQ9H963 129 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC01619G3V211 115 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.75□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM160Q9NX00 188 aa11.75□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 MED13LQ71F56 2210 aa11.75□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 C9orf118A6NHY6 69 aa11.74□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 RNF223E7ERA6 249 aa11.73□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.73□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.73□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.72□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF688P0C7X2 276 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 SRD5A1P18405 259 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00315P59091 139 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 NRGNQ92686 78 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 CSTL1Q9H114 145 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.72□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.71□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 SYNJ2BPP57105 145 aa11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-202ENST00000460567 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.71□□□□□ -0.53
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SUCLG2-202ENST00000460567 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.71□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.71□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF843Q8N446 348 aa11.71□□□□□ -0.54
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SUCLG2-202ENST00000460567 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.7□□□□□ -0.54
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SUCLG2-202ENST00000460567 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 RIPPLY3P57055 190 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 Q5PR19 223 aa11.7□□□□□ -0.54
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SUCLG2-202ENST00000460567 Q6ZVH6 145 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 JMJD8Q96S16 334 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 26.2
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SUCLG2-202ENST00000460567 OR11H12B2RN74 326 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 RHOHQ15669 191 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 OR11H1Q8NG94 326 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 OR11H2Q8NH07 326 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.68□□□□□ -0.54
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SUCLG2-202ENST00000460567 PTH2Q96A98 100 aa11.68□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 E9PLD3 99 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 F5H697 171 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 HERVK_113P61574 105 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 CEND1Q8N111 149 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 EDN2P20800 178 aa11.67□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.67□□□□□ -0.54
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SUCLG2-202ENST00000460567 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.66□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 PMVKQ15126 192 aa11.66□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 AMTNQ6UX39 209 aa11.66□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8N1Y9 231 aa11.66□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 GCSHP23434 173 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 AKAP6Q13023 2319 aa11.65□□□□□ -0.54
SUCLG2-202ENST00000460567 IGIPA6NJ69 53 aa11.64□□□□□ -0.55
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