RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.8□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 LTAP01374 205 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 ASIPP42127 132 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 TNP2Q05952 138 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.79□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 B4DEV8 164 aa11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 DNLZQ5SXM8 178 aa11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 IL36BQ9NZH7 164 aa11.78□□□□□ -0.52
ANKRD54-208ENST00000458278 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SH2D1AO60880 128 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 AKR1C3P42330 323 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 CRIP1P50238 77 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 RAB5CP51148 216 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.77□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1B0GV50 99 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 A8MWV9 139 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 K7EP13 123 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 TIRAPP58753 221 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 RHOHQ15669 191 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.76□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 MED14OSP0DP75 135 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC01559Q495D7 138 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZNX1 250 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 C1QBP02746 253 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC00315P59091 139 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 MANBALQ9NQG1 85 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 TEX46H3BTG2 121 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 H3BVH4 76 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 M0R036 132 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SYT8Q8NBV8 401 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 PARLQ9H300 379 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC51BQ86UW2 128 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 MLST8Q9BVC4 326 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 EVI2AP22794 236 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SULT1A2P50226 295 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 NFE4Q86UQ8 179 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF575Q86XF7 245 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 BAGE2Q86Y30 109 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 GNG13Q9P2W3 67 aa11.71□□□□□ -0.53
ANKRD54-208ENST00000458278 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 RHODO00212 210 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 CCL20P78556 96 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.7□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 CXCL1P09341 107 aa11.69□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 AKAP14Q86UN6 197 aa11.69□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.69□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 C11orf52Q96A22 123 aa11.69□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 HERC2O95714 4834 aa11.69□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 C16orf90A8MZG2 172 aa11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZSN1 163 aa11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 ZFP82Q8N141 532 aa11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 JPT2Q9H910 190 aa11.68□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 SFRP2Q96HF1 295 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.67□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 IFNA1P01562 189 aa11.66□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 CRYGDP07320 174 aa11.66□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC00694P0DN24 101 aa11.66□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 LELP1Q5T871 98 aa11.66□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.66□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 M0R381 172 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 PDE6DO43924 150 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.65□□□□□ -0.54
ANKRD54-208ENST00000458278 DERL1Q9BUN8 251 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms